1949年12月??解放后的首座南京汽車站在長江路280號投入運行。

1954年5月??南京市成立了第一家專業(yè)汽車隊，擁有客車13輛，經(jīng)營路線145公里。

1965年8月??南京汽車站與汽車隊合為一體運營，隸屬江蘇省交通廳南京汽車運輸處。

1968年9月??作為南京長江大橋配套工程之一的南京中央門長途汽車站全面開始建設(shè)。南京浦口汽車站撤銷，人員業(yè)務(wù)并入中央門汽車站。

1969年10月1日 ?中央門長途汽車站建成通車，南京到鹽城、南通等班線陸續(xù)開通。

1975年8月??江蘇省南京汽車運輸處分立，分別成立江蘇省第一、第二汽車運輸處，客運業(yè)務(wù)劃歸江蘇省第二汽車運輸處經(jīng)營。

1978年1月 ?中央門長途汽車站、江蘇省二、四、六客車隊、省第十三零擔(dān)車隊、珠江路保養(yǎng)廠等劃歸第二汽車運輸處。總部地址遷至南京市建寧路1號。從此，南京市的長途汽車客運走向了專業(yè)化經(jīng)營的軌道。

1983年 ?南京長途汽車站被評為交通部文明車站。

1983年6月 ?江蘇省汽車運輸公司成立。?江蘇省第二汽車運輸處成立第八車隊。

1984年3月??江蘇省第二汽車運輸處更名為江蘇省汽車運輸公司南京客運分公司。隨后高淳、溧水兩站及原省二十二車隊劃歸南京客運分公司，第二十二車隊經(jīng)過整合，成立第十二、十四車隊。年底，成立第十車隊。企業(yè)生產(chǎn)規(guī)模迅速擴大。

1985年1月??江蘇省汽車運輸公司南京客運分公司屬地化管理，劃歸南京市交通局管理。

1986年后 ?分別成立公鐵分流南京公司、寧港集裝箱運輸有限公司、太平洋旅游運輸有限公司等。南京客運分公司成立第十六、十八汽車隊。

1990年2月 ?南京客運分公司珠江路汽車大修廠整體搬遷至賽虹橋廠區(qū)。

1991年6月??江蘇省汽車運輸公司南京客運分公司更名為江蘇南京長途汽車客運總公司。

2005年11月??江蘇南京長途汽車客運總公司整體改制，成立江蘇南京長途汽車客運集團有限責(zé)任公司。

2013年??參與全省14家專業(yè)客運企業(yè)，組成聯(lián)盟，成立江蘇長運公司，發(fā)展接駁運輸，實現(xiàn)全省聯(lián)網(wǎng)售票。

2014年8月? 運營了45年的中央門汽車站整體搬入南京公路客運站（小紅山汽車站）。同月，長客集團圓滿完成了“青奧會”的交通運輸保障任務(wù)。

2014年12月??南京市旅游集散中心在汽車東站正式開業(yè)經(jīng)營。

2015年11月??由江蘇南京長途汽車客運集團有限責(zé)任公司和江蘇長運定制客運服務(wù)有限公司共同投資組建江蘇長運定制客運服務(wù)有限公司南京公司。公司以“巴士管家”為平臺，以實現(xiàn)公路客運服務(wù)“門到門”為核心，主營業(yè)務(wù)包括定制巴士（城鄉(xiāng)定制、縣際定制、通勤廠包車定制）、定制快車（省、市及快車）、商務(wù)快車（公務(wù)快車、商務(wù)快車）、機場接送（專線大巴、機場快車）、校園專線、旅游用車、小件快運等。

2016年8月??南京公路客運站務(wù)有限公司成立。

2016年9月?吉利集團旗下戰(zhàn)略品牌曹操專車正式落地南京，由吉利集團旗下子公司杭州優(yōu)行科技有限公司和南京長客集團旗下子公司南京利凱汽車租賃有限公強強聯(lián)手，合資成立南京長客優(yōu)行科技有限公司，負責(zé)南京曹操專車運營。

2017年1月??開通南京環(huán)城游觀光巴士，首批開通3條線路，覆蓋了中山陵、大報恩寺等新老景點，每20分鐘發(fā)出一班。

2017年12月??南京汽車客運南站旅游集散中心正式啟用，“南京環(huán)城游”觀光巴士第10條線路同步開通，串聯(lián)起南京南站、雨花臺、侵華日軍南京大屠殺遇難同胞紀念館。

2018年7月 ?集團公司承擔(dān)2018年道達爾杯世界羽毛球錦標賽交通保服務(wù)障工作，服務(wù)用車67輛，注冊駕駛員97人，注冊賽事保障人員78人，以“零投訴、零失誤”的成績圓滿完成任務(wù)。

2018年?8月???投資成立南京長客非急救轉(zhuǎn)運服務(wù)有限公司，是南京市政府授權(quán)的承運南京市非急救轉(zhuǎn)運社會化服務(wù)的獨家試點企業(yè)，為南京市民康復(fù)出院與年老體弱等特殊人群的非院前醫(yī)療急救服務(wù)、個性化服務(wù)需求的轉(zhuǎn)院轉(zhuǎn)運，提供正規(guī)、安全、舒適、優(yōu)質(zhì)、高效的出行保障服務(wù)。

2021年8月 ?公司代表南京交通運輸團隊，緊急抽調(diào)50輛大型客車、63名駕駛員前往揚州，援助轉(zhuǎn)運集中隔離人員。援揚半個月期間，累計出車200余趟次，實現(xiàn)了零感染、零事故、零投訴。

2021年9月、10月 ?寧高公司與潤溧公司分別完成收購飛凱公司和溧晨公司股權(quán)，通過收購統(tǒng)籌和集約區(qū)域性客運資源，盤活和利用經(jīng)營資質(zhì)，為公司可持續(xù)發(fā)展創(chuàng)造條件。

2022年4月-12月 ??4月4日凌晨，集團所屬白鷺公司30輛大巴馳援上?？挂?，往返上海十四趟次，為援滬南京醫(yī)療隊提供了安全、舒心的交通運輸服務(wù)；5月30日，公司抽調(diào)51名職工支援南京南站轉(zhuǎn)運專班，至專班工作結(jié)束，公司累計派出人員十三批次，超500人次參加過南京南站轉(zhuǎn)運專班工作，他們歷經(jīng)夏季高溫、國慶大客流等各種考驗，均出色完成了防疫轉(zhuǎn)運任務(wù)，為南京交通戰(zhàn)疫貢獻了長客力量。

新冠肺炎疫情發(fā)生以來，公司還陸續(xù)承擔(dān)了南京市公共衛(wèi)生醫(yī)療中心醫(yī)護人員通勤班車保障、海南返寧人員轉(zhuǎn)運、新疆返寧人員轉(zhuǎn)運等交通運輸任務(wù)，以實際行動支持抗疫。

2023年10月? ?集團啟動運輸板塊整合，按照運輸業(yè)務(wù)類型劃分為班線運輸和非班線運輸。班線運輸以長運公司為主體，非班線運輸以白鷺公司、東渡（定制）公司為主體，大力拓展非班線運輸市場。